一般情況下，女性在孕早期時，陰道出現少量褐色分泌物可能是陰道炎、異位妊娠、先兆流產等因素所致，可以通過日常調理、手術治療、藥物治療的方式進行治療。具體分析如下：
1.陰道炎：陰道炎一般是由細菌、病毒等感染引發的一種陰道炎症，女性在妊娠初期如果患有陰道炎，可能會出現陰道有褐色分泌物的情況，還可能表現為陰道瘙癢、灼痛等，建議女性遵醫囑使用克霉唑栓、苦參凝膠等藥物緩解癥狀。
2.異位妊娠：異位妊娠一般指孕卵在子宮腔外著床發育的異常妊娠過程，考慮是輸卵管過長、子宮內膜異位症等因素引起的，一般表現為妊娠早期陰道不規則出血，多為褐色分泌物，還可能伴有腹痛、腹部包塊、停經等癥狀，建議及時前往醫院通過輸卵管開創術、輸卵管切除術等手術進行治療。
3.先兆流產：先兆流產是指女性在妊娠28周內，由於內分泌異常、免疫排斥等，引起少量陰道出血、陣發性腹痛等癥狀的情況，可能為褐色分泌物。建議女性遵醫囑服用黃體酮膠囊、保胎無憂片等保胎的藥物治療，嚴重時可能需要通過負壓吸引術、鉗刮術等方式終止妊娠。
除以上原因外，也可能是其他原因所致，如宮頸炎，建議及時進行治療。