一般情況下，小學生內褲上有褐色分泌物，可能是月經初潮、尿路感染、陰道炎等原因造成的。建議家長及時帶孩子前往醫院，在醫生的指導下通過應用藥物、改善生活習慣等方式進行治療。
1、月經初潮：月經初潮的年齡通常在11到19歲，由於卵巢性腺軸沒有發育完全，不會發生排卵，但是子宮內膜會進行脫落，進而導致小學生內褲上有褐色分泌物。這是種正常生理現象，無需進行特殊治療，日常生活中注意個人衛生即可。
2、尿路感染：如果患者免疫力低下，受到細菌感染，可能會誘發尿路感染，出現尿頻、尿急、尿痛、陰部不適等癥狀，進而導致小學生內褲上有褐色分泌物。患者可以在醫生的指導下使用頭孢克洛膠囊、阿莫西林膠囊等藥物進行治療。日常生活中建議多飲水，適當多吃一些富含蛋白質、維生素等營養物質的食物，從而對身體的恢復起到一定的幫助作用。
3、陰道炎：陰道炎主要是由於病原微生物感染、個人免疫力低下等所導致，患者會出現陰道瘙癢、燒灼感、陰道分泌物增多、顏色異常等癥狀，進而導致小學生內褲上有褐色分泌物。患者可以在醫生的指導下使用甲硝唑凝膠、高錳酸鉀溶液等藥物進行治療，日常生活中勤換內衣內褲。