指甲蓋里有黑點可能是污染物淤積這一非病理性因素引起的，也可能是局部外傷、真菌感染、黑色素瘤等病理性因素引起的，需要根據具體病因進行治療。
一、非病理性因素
患者平時如果沒有注意清理指甲內的污染物，可能會出現指甲蓋黑點的情況，一般不需要特殊治療，平時注意清理污染物即可。
二、病理性因素
1、局部外傷：如果患者受到了外傷，比如撞擊、擠壓等，就可能會出現該癥狀，建議患者遵醫囑服用活血化瘀的藥物進行治療，比如三七片、舒筋活血片等。
2、真菌感染：指甲有黑點、皮膚脫屑都可能是真菌感染的癥狀表現，建議患者遵醫囑使用丁克鹽酸特比萘芬乳膏、酮康唑乳膏等抗真菌的藥物進行治療。
3、黑色素瘤：指甲蓋里有黑點可能是發生在指甲蓋的惡性腫瘤，患者可以接受皮膚腫瘤切除術進行治療。
如果出現指甲蓋里有黑點的癥狀，建議患者及時前往醫院通過體格檢查、皮膚真菌鏡檢等方式，在明確病因后對症治療。治療期間患者要注意多吃營養豐富的食物，比如雞蛋、瘦肉、火龍果、葡萄等，有利於身體恢復。