早晚咳嗽需針對病因選擇合適方法治療，環境藥物因素所致的應避免接觸不良誘因，炎症感染者需口服止咳消炎藥治療，過敏性疾病所致應服用止咳藥和抗組織胺葯治療。
1.解除誘因
對於受到環境或藥物刺激所致的早晚咳嗽，一般及時解除誘因即可。建議要遠離不良環境，儘可能待在濕度適宜和乾淨的環境中，且應暫停服用血管緊張素轉化酶抑製劑、抗心律失常藥物和抗腫瘤葯等可引起咳嗽的藥物。
2.止咳消炎藥
若是肺部或支氣管等部位受到炎症感染，如患上肺炎或支氣管炎，會引起早晚咳嗽，患者需服用止咳鎮咳葯和消炎抗菌葯治療，常用藥有鎮咳寧糖漿、復方甘草口服溶液、阿莫西林膠囊等，以及時緩解咳嗽癥狀，消除局部炎症。若炎症較嚴重，如已引起膿胸等癥狀，則要及時行外科手術。
3.抗組胺葯
哮喘等過敏性疾病會導致早晚咳嗽，此時一定要及時查找並遠離可能的過敏原，如花粉或動物皮毛、粉塵等物質。患者除了要服用復方甘草片、強力枇杷露、蘇黃止咳膠囊等止咳鎮咳葯緩解外，還要搭配服用抗組織胺類藥物，如氯雷他定片、氯雷他定糖漿等，可儘快促使自身免疫功能恢復，及時消除過敏性反應。