每天排出的糞便是深色的原因可能是飲食因素、藥物因素、食管炎、細菌性痢疾、十二指腸潰瘍等，一般可結合原因採取改善措施。
1、飲食因素：如果吃了一些富含色素的食物，比如木耳、紫甘藍、動物肝臟、豬血等，可能導致糞便顏色比較深，屬於正常的生理現象，一般是不需要特殊處理的。
2、藥物因素：如果在醫生指導下服用了補鐵類的藥物，比如硫酸亞鐵片、硫酸亞鐵糖漿等，可能會導致糞便顏色呈深褐色或黑色，一般在醫生建議下停用藥物后癥狀會逐漸消失。
3、食管炎：炎症反覆刺激食管可能誘發該疾病，導致局部黏膜破損並引發出血，導致每天排出的糞便是深色的，可配合醫生使用阿莫西林膠囊、頭孢克肟膠囊等藥物來調理。
4、細菌性痢疾：細菌感染腸道、腸道菌群失調等可能誘發該疾病，導致糞便顏色改變、排便次數增多等癥狀，可在醫生建議下服用鹽酸米諾環素膠囊、腸炎寧顆粒等藥物來減輕身體不適。
5、十二指腸潰瘍：由於局部有潰瘍面破損出血的原因，導致糞便顏色較深，可遵醫囑使用奧美拉唑腸溶膠囊、雷貝拉唑鈉腸溶膠囊等藥物來調理。
如果癥狀比較嚴重，應及時前往醫院接受檢查與治療，以免延誤病情。