灌腸一般不痛，但是會產生不舒服的感覺。
灌腸是將一定量的溶液直接注入直腸結腸，刺激直腸結腸的蠕動而引起排便。一般分為保留灌腸和清潔灌腸兩種，其中保留灌腸是用導管從肛門經過直腸插入結腸，並灌注液體藥物，讓藥物留在腸腔內，刺激腸蠕動使之軟化，從而達到清除糞便的作用。而清潔灌腸是指用肥皂水或清潔水通過肛門經直腸緩緩地灌入結腸，幫助病人排出糞便和積存的氣體。這兩種灌腸都會使患者出現輕微腹脹、腹痛的感覺，此外，部分患者還可能在灌腸的過程中發生臉色蒼白、心慌、氣促等不良反應，所以一般來講，灌腸都存在一些不舒服的感覺。
需要注意的是，灌腸插管時，動作一定要輕緩，應該順應腸道的解剖特點，不可用力過猛，以免傷及肛門。同時，在灌腸的過程中，患者出現不適反應，如出冷汗、心慌、面色蒼白等癥狀，應立即停止灌腸。