甲氧嘧啶通常指磺胺間甲氧嘧啶，甲氧苄啶指甲氧苄啶片。一般情況下，磺胺間甲氧嘧啶和甲氧苄啶片的區別有適應症不同、禁忌不同。具體分析如下：
1.適應症不同：磺胺間甲氧嘧啶主要用於治療敏感菌所致的尿路感染、腸道感染和皮膚軟組織感染。甲氧苄啶片主要用於對治療大腸埃希菌、奇異變形桿菌、肺炎克雷伯菌和某些腸桿菌屬、腐生葡萄球菌等細菌所致的急性單純性下尿路感染的初發病例。
2.禁忌不同：磺胺間甲氧嘧啶小於2個月的嬰兒和重度肝腎功能損害者禁用本品。甲氧苄啶片新生兒、早產兒和嚴重肝腎疾病、血液病患者禁用。
建議患者保持局部清潔衛生，避免加重感染。