可從病變部位、臨床癥狀、腦電圖檢查結果等方面鑒別真性球麻痹與假性球麻痹。
1.病變部位
真性球麻痹是舌下神經和運動神經元神經受損導致，病變部位在延髓；假性球麻痹是雙側運動元受損導致，病變部位在皮質延髓束。
2.臨床癥狀
在患病早期真性球麻痹與假性球麻痹癥狀類似，都有飲水嗆咳、吞咽困難、語言含混不清、構音障礙等表現，但二者也存在一些差別。真性球麻痹可導致下頜反射消失，咽反射消失，無強哭強笑表現；假性球麻痹存在下頜反射亢進表現，伴隨肌張力增高、腱反射活躍、強哭強笑、排尿障等表現。
3.腦電圖檢查結果
想要區分真性球麻痹與假性球麻痹時，還可做腦電圖檢查。真性球麻痹患者腦電圖無異常，假性球麻痹患者做腦電圖檢查時可看到瀰漫性異常表現。