羊水穿刺確實有一定的風險，如果利用羊水穿刺，作為診斷是否患有某一疾病，是不會有明確結果的，只是說明患這種病的可能性比較大，而且做這個檢查需要在胎兒十六周至二十周之間，胎兒過大或者過小都不適合做這個檢查。
女性懷孕之後，需要做定期的檢查，來了解胎兒在母體里的發育情況，羊水穿刺是女性孕期檢查項目的其中之一，可以通過這項檢查了解胎兒的發育是否正常，以便做到更好的優生優育，大家都清楚羊水穿刺存在一定的風險，那麼，羊水穿刺風險高嗎？
1、診斷的風險
羊水穿刺並不是100％能夠得到正確的診斷結果，經大量醫學資料表明，抽取羊水進行唐篩檢查只能幫助判斷胎兒患有唐氏症的機會有多大，但不能明確胎兒是否患上唐氏症。另一方面，即使化驗指數正常，也不能保證胎兒肯定不會患病。篩查的目的不是診斷某一種疾病，而是篩選出患某一疾病可能性較大的人。
2、羊水穿刺危險性
羊水穿刺檢查方法，對母親或胎兒造成風險的可能性在0.5％到1.5％之間。因此不是每個孕婦都需要羊膜穿刺術。還有另外一個重要的缺點：這種羊膜穿刺術要等胎兒發育到十六周至二十周之間才能實施，就算是發現胎兒有遺傳性疾病，但很難決墜胎。
3、羊水穿刺的併發症
在早期發表的研究報告指出，因羊水檢查而導致胎兒死亡的機率約1.5～3.5％。而根據目前最新的研究報告則指出，若是單胞胎接受羊膜腔穿刺，胎兒死亡機率為0.6％;若是雙胞胎接受羊膜腔穿刺，則機率提高到2.7％。
4、可能的副作用
約有2～3％的孕媽，在穿刺後會出現輕微的子宮收縮及陰道流血，可能會出現陰道血、羊水溢出或子宮持續性收縮，約佔2％的孕婦會發生自發性流產，約佔0.3％至0.5％。僅約有0.5％的孕媽會出現羊膜炎、胎膜破裂及流產，如有過敏史，特殊疾病史和其他需要說明的情況，請在術前登記時告知醫生。