翻瓣手術的好處是有利於進一步探查、視野清晰、手術阻力小。弊端是腫脹疼痛明顯，可能導致牙齦壞死、牙齦萎縮等。
牙齒翻瓣手術是最基本的牙周手術，手術時會將牙周袋內壁切除，翻開黏骨膜瓣，在直視情況下為根面和軟組織清創，再將瓣膜複位、縫合。翻瓣術暴露出牙槽骨，有利於進一步的探查，如殘根斷面暴露后，可探查牙根表面是否存在根縱裂，頜骨囊腫時可通過翻瓣術明確囊腫位置。翻瓣術后醫生視野更清楚，便於操作，還可減少軟硬組織的阻力，可輕鬆去除部分骨質或牙齒，徹底清除牙槽窩中的殘留肉芽組織。
但牙齒翻瓣手術的創傷較大，術后局部腫脹、疼痛癥狀特別明顯。術后護理不當，局部感染，可使腫痛癥狀加重。在進行翻瓣手術時，會切斷牙齦的供血，術後有可能出現牙齦壞死、牙齦萎縮併發症等。