沒有效果最好的藥膏可以治療膝蓋半月板損傷，應根據損傷的具體情況進行選擇。急性期可選擇消炎鎮痛的藥膏，病情穩定后再去應用活血化瘀的藥膏。
膝蓋半月板損傷發生初期會有劇烈疼痛以及腫脹現象，急性期可以應用消炎鎮痛類的藥膏，如氟比洛芬凝膠貼膏、復方南星止痛膏、消炎鎮痛膏等。這些藥膏中含有較多的止痛成分，通過皮膚吸收之後可以緩解局部疼痛，還能減少膝關節血液滲出，改善軟組織的水腫反應，避免腫脹和疼痛的癥狀持續加重。
受傷兩天之後淤血處於機化階段，病情較為穩定，可選擇活血化瘀類藥膏，如壯骨麝香止痛膏、雲南白藥膏、三七傷藥膏等。這類藥物含有大量的活血成分，能夠活血化瘀，減輕皮下淤血，並促進淤血吸收，消除腫脹。在一定程度上改善疼痛癥狀，促進損傷恢復。