一般情況下，舌根一側疼，咽口水都疼，可能是口腔潰瘍、扁桃體炎、咽炎等因素導致的，可以通過藥物治療、飲食改善等方式緩解病情。具體分析如下：
1.口腔潰瘍：通常和精神緊張、局部創傷、維生素缺乏等有關，常見疼痛、局部灼燒感等不適癥狀，隨著病情發展，炎症因子侵犯舌根，導致舌根發炎，從而出現患側疼痛的情況。患者需要謹遵醫囑使用氯己定含漱液、康復新液等藥物緩解癥狀。
2.扁桃體炎：通常和抵抗力下降、病毒感染等有關，常見雙側咽部均明顯疼痛，吞咽時疼痛加劇，伴隨發熱、畏寒等癥狀。患者需要謹遵醫囑使用阿莫西林膠囊、羅紅霉素片等藥物緩解癥狀。建議平時飲食以清淡為主，增加蛋類、魚類、禽類的攝入，有利於身體恢復。
3.咽炎：通常和腺病毒、副流感病毒等病毒感染有關，常見咽部不適感、吞咽困難、口臭、咽痛等癥狀，嚴重時可能會導致呼吸困難。患者需要謹遵醫囑使用復方金銀花顆粒、阿莫西林膠囊、羅紅霉素片等藥物緩解癥狀。
除以上常見原因外，還可能是其他因素導致的，例如舌癌。如果不適癥狀比較嚴重，建議立即就醫。