起床眼睛疼可能是睡眠不足這種非病理因素引起的，也可能是細菌性結膜炎、病毒性角膜炎、青光眼等病理因素造成的。
一、非病理因素
如果患者長時間熬夜，可能會導致睡眠不足，造成眼部疲勞，所以在起床的時候就容易使眼部酸脹疼痛。當患者出現這種情況時，通常不需要進行治療，平時應避免長時間熬夜。
二、病理因素
1、細菌性結膜炎：如果患者存在細菌性結膜炎，表明眼部存在炎症反應，可能會導致眼睛畏光、分泌物增多等，還可能造成眼部異物感、疼痛等，且疼痛癥狀比較劇烈。建議患者遵醫囑外用紅霉素眼膏、左氧氟沙星滴眼液等藥物進行抗菌治療。
2、病毒性角膜炎：如果身體的免疫功能低下，容易導致角膜的防禦能力減弱，還可能造成病毒侵入角膜組織，從而引發病毒性角膜炎，出現眼痛、畏光等癥狀，伴隨視力下降、流淚等情況。建議患者遵醫囑外用更昔洛韋滴眼液、阿昔洛韋滴眼液等藥物進行抗病毒治療。
3、青光眼：如果患者的眼內房水無法流通，可能會引發眼壓升高，導致眼部神經受到損傷，從而引發青光眼，可以表現為眼球脹痛、視力下降、眼球充血等。建議患者遵醫囑使用酒石酸溴莫尼定滴眼液、貝美前列素滴眼液等藥物減少房水生成，達到降低眼壓的效果。
如果存在起床眼睛疼的情況，建議患者及時前往醫院就診，完善體格檢查、眼底檢查等，明確病因后再對症治療，有利於控制病情。在日常生活中，患者需要注意眼部衛生，保護視力，避免出現視疲勞，同時還需要適當進行體育鍛煉，如慢跑、跳繩等。