通常情況下，長跑完嗓子疼可能是空氣刺激咽喉、慢性咽炎、扁桃體炎等原因引起的，可以通過服用藥物、日常護理的方法來緩解。具體分析如下：
1.空氣刺激咽喉：長跑時間較長，咽喉部位長時間換氣，空氣不斷刺激局部，可能導致咽喉腫脹、充血，出現疼痛、刺癢等不適癥狀。這種情況下，多喝溫水，避免過度說話可以減輕不適癥狀。
2.慢性咽炎：慢性咽炎是咽喉黏膜、淋巴組織出現的炎症反應，與沒有完全治癒的急性咽炎有關。患者在長跑之後，會因為過度的換氣誘發該病，從而出現局部有異物感、刺痛等不適癥狀。建議患者遵醫囑服用紅霉素片、青霉素V鉀片、阿莫西林片等藥物緩解不適，並且可以多喝水，食用新鮮的水果，補充維生素，加快還不適癥狀消失的速度。
3.扁桃體炎：扁桃體炎是細菌感染扁桃體引起的，主要癥狀為咳嗽、咽喉疼痛、局部異物感染等。扁桃體炎患者在長跑后，可能因為過度勞累、對扁桃體的刺激過大，加重不適癥狀，患者可以遵醫囑服用鹽酸克林黴素片、頭孢氨苄干混懸劑、復方金銀花顆粒等藥物進行緩解，同時避免過度說話，勤喝水。
出現上述癥狀的原因較多，也可能是局部受涼引起的，可以通過喝溫熱水來緩解不適。