飛蚊症可以到醫院掛眼底病科、眼全科門診等相關科室就診，具體科室根據就診醫院確定。
1、眼底病科
飛蚊症為眼科疾病，而眼科疾病有詳細劃分，可以到眼底病科就診。飛蚊症主要由玻璃體液化、渾濁、視網膜裂孔等其他眼科疾病所致。到眼底內科就診，通過相應儀器檢查，發現具體誘因，並與醫生做出針對性治療方案。
2、眼全科門診
若就診醫院未有眼底病科，可到醫院眼全科門診診治。眼全科門診適用於治療飛蚊症等各種眼部疾病，治療疾病效果更有保障。但是由於治療疾病範圍較廣，專業化、與專註力不如眼底病科室。若醫院有眼底病科，應優先選擇眼底病科就診。