孩子不舒服，睡覺吧唧嘴，可能是大腦皮層發育不成熟、胃食管反流等原因引起的，可通過日常調理、使用藥物、手術等方式改善相關情況。具體分析如下：
1.大腦皮層發育不成熟：孩子不舒服，睡覺的時候經吧唧嘴，可能是孩子的大腦皮層發育得不是特別成熟，出現了神經衝動，神經中樞不能夠控制某些肌肉群的運動，從而出現相關癥狀，甚至會出現翻身和哭鬧的情況，一般不需要做特殊治療，輕輕安撫孩子入睡即可。孩子在小的時候，身體發育速度比較快，一定要給孩子補充足夠的營養，只有孩子的營養跟得上或者均衡，孩子才會發育得更健康。
2.胃食管反流：入睡之後尤其平躺的時候，胃內的胃酸、胃內容物經食管反流到口腔裡面，孩子會將反流口腔內的汁液經過吞咽功能再次回到胃裡，從而出現孩子不舒服，睡覺吧唧嘴的情況。家長可在醫生的指導下給孩子服用多潘立酮片、胃膜素片等藥物進行治療，有中和胃酸的效果。還要保持清淡飲食，適當增加運動。