幽門螺桿菌一般採用抗幽門螺桿菌四聯療法的藥物進行治療，包括兩種抗生素、一種質子泵抑製劑和一種鉍劑四種葯。
1.兩種抗生素
抗生素的作用主要是抗炎和殺滅幽門螺桿菌，常用藥物有阿莫西林、克拉黴素、羅紅霉素、甲硝唑、四環素等。在上述抗生素中根據自身藥物敏感度和是否過敏選擇兩種進行治療，一般無特殊情況會選擇阿莫西林和克拉黴素。
2.一種質子泵抑製劑
質子泵抑製劑屬於抑制胃酸的藥物，可有效保護胃黏膜，代表性藥物有奧美拉唑、雷貝拉唑、泮托拉唑、蘭索拉唑等。
3.一種鉍劑
鉍劑主要包括枸櫞酸鉍鉀、膠體果膠鉍、膠體酒石酸鉍等藥物，此類葯副作用可以使大便變黑，口內出現異味。鉍劑是一種黏膜保護劑，可在酸性環境下產生沉澱，形成彌散性的保護層，覆蓋於潰瘍面上，促進潰瘍黏膜再生和潰瘍癒合。