進行HPV檢查時，可以根據醫院科室的設置，相應選擇婦科宮頸門診、婦科、婦產科等科室挂號就診。
1.婦科宮頸門診：女性進行HPV檢查時，大多是進行宮頸癌篩查，會從宮頸內提取分泌物及宮頸上皮細胞進行相關檢查。有些三甲醫院或者專科醫院的科室分類比較細，婦科還設有普通婦科門診、宮頸門診、不孕不育門診等，進行HPV檢查時可掛婦科宮頸門診。
2.婦科：一般醫院級別越低，科室分類越不細。在二甲醫院可能只有婦科、產科之分，並無詳細的門診分類。想要做HPV檢查時，可在月經乾淨3-7天內去婦科挂號檢查。注意檢查前3天內不可同房，不可陰道上藥和陰道沖洗，以免影響檢查結果的準確性。
3.婦產科：有些醫院的婦科和產科合併為一個科室，如婦幼保健站等醫院，女性進行HPV檢查時，也可去婦產科挂號就診。