常見的腸道致病菌主要是大腸桿菌和沙門氏菌，兩種病菌都可能會感染腸道，引起腸道疾病。具體如下：
1.大腸桿菌：大腸桿菌是一種寄生於人體或動物大腸內部的細菌，形態為兩端鈍圓。普通的大腸桿菌在正常的棲居條件下一般是不致病的，但如果侵入膀胱或膽囊，可能會引起炎症反應。同時大腸桿菌當中的O157：H7血清型可能會導致患者感染腸道疾病，出現腸道出血、腹瀉的癥狀。
2.沙門氏菌：沙門氏菌是副傷寒的病原體。按照抗原成分分類，沙門氏菌一般有甲、乙、丙、丁、戊五種菌組。其中能使人患有疾病的主要為甲組的傷寒甲桿菌、乙組的傷寒乙桿菌、鼠傷寒桿菌。如果感染上述細菌，可能會導致患者出現副傷寒這一腸道疾病，出現嘔吐、腹痛、腹瀉等不適癥狀。此時建議患者遵醫囑服用阿莫西林顆粒、左氧氟沙星片等消炎、抑菌的藥物進行治療。