鹼性磷酸酶偏高可分為生理性和病理性因素，可給予藥物治療、手術治療等改善偏高癥狀，具體如下：
1.原因
生理因素，在骨骼、肝臟、腎臟、胎盤等部位都有鹼性磷酸酶的存在。骨骼生長、妊娠、脂肪餐後分泌等生理因素導致了這一酶升高。生理性升高無需特殊處理。病理性升高多見於骨骼及肝臟疾病。骨軟化病、成骨細胞瘤、骨折癒合等都是常見的骨骼疾病。胰頭癌、膽管結石、原發性膽汁性肝硬化、肝炎等都屬於肝膽疾病。此外，營養不良、中度貧血、胃、十二指腸受損等情況下，也有可能出現這種情況。
2.治療
治療鹼性磷酸酶偏高，要重視對原發病的控制。對於纖維性骨炎，可以選擇磷結合劑、鈣劑、骨化三醇等進行治療。患有骨質疏鬆的患者需要服用維生素D及鈣劑。手術是成骨細胞瘤的首選方法，同時還可以進行放射治療和對症藥物的治療。胰頭癌的治療主要是手術為主，對於已經失去手術機會的患者，可以選擇放療和化療。根據患者的情況，可以選擇開腹或腹腔鏡進行治療。糖皮質激素、熊去氧膽酸等藥物可以用於原發性膽汁性肝硬化。肝炎患者需要進行病因干預，並配合護肝、降酶處進行治療。