孩子嗓子疼咳嗽，應根據具體原因採取相應的治療措施。若是支原體肺炎所致，可用大環內酯類抗生素及止咳化痰的藥物治療；若是單純的病毒感染，病情較輕無需治療，病情嚴重可服用清熱解毒的中成藥；若是細菌感染，需要應用抗生素類藥物治療。
小孩子嗓子疼咳嗽可能是支原體感染引起的支原體肺炎所致，需要應用大環內酯類抗生素進行治療，如咳嗽嚴重，伴有明顯的咳痰癥狀，還需配合使用止咳化痰的藥物，常用的是阿奇黴素干混懸劑、肺力咳合劑、復方鮮竹瀝口服液等。
孩子嗓子疼咳嗽也可能是單純的病毒感染引起的，病毒感染有一定的自限性，如病情較輕，建議多喝些溫開水，癥狀可以慢慢緩解。但如果病情嚴重，可以在醫生指導下服用清熱解毒的中成藥來治療，如小兒熱速清顆粒、小兒豉翹清熱顆粒、蒲地藍消炎口服液等。
部分兒童嗓子疼咳嗽是由於細菌感染引起的，需要給予廣譜抗生素治療，首選的是青霉素類抗生素。若對青霉素過敏，可以選擇頭孢類的抗生素，常用的是阿莫西林顆粒、頭孢克肟顆粒、頭孢呋辛酯片等。