一般情況下，並沒有「EB病毒吃什麼葯最好」的說法，可以吃更昔洛韋分散片、鹽酸伐昔洛韋片、阿昔洛韋片等藥物，用藥時需謹遵醫囑。具體分析如下：
1、更昔洛韋分散片：為抗病毒藥，常用於免疫功能損傷引起巨細胞病毒感染的患者，也可治療EB病毒引起的疾病。
2、鹽酸伐昔洛韋片：主要用於治療水痘帶狀皰疹及Ⅰ型、Ⅱ型單純性皰疹病毒感染，包括初發和複發的生殖器皰疹病毒感染。對於EB病毒，也能起到抗病毒的作用。
3、阿昔洛韋片：主要用於生殖器皰疹病毒感染初發和複發單純皰疹病毒感染病例，對反覆發作病例口服本品用作預防，感染EB病毒后也可遵醫囑服用此藥物。
除以上藥物外，還可以遵醫囑吃其他藥物，例如醋酸潑尼松片。如果癥狀比較嚴重，建議及時就醫，在醫生的指導下對症治療，不能自行盲目用藥。