HPV分型檢查一般不能依靠單一檢查項目，通常要結合醋酸白試驗、巴氏塗片法、PCR檢測等方式綜合判斷感染類型。
1.醋酸白試驗：HPV分型檢查主要是檢測HPV病毒的類型，通常包括黏膜型、皮膚型，即感染黏膜和皮膚，又分為高危型和低危型。分型檢測可以檢查出14種高危HPV亞型，以及九種低危的HPV亞型。正常情況下宮頸表面布滿鱗狀上皮，陰道鏡下觀看表面比較光滑，塗抹3%的醋酸后不變色。在陰道鏡下做醋酸白試驗，如果出現上皮迅速腫脹、變白、呈葡萄樣改變，說明檢查異常。
2.巴氏塗片法：巴氏塗片法一般是用陰道窺鏡的儀器來擴張陰道內壁，從宮頸部取少許細胞樣品，放在載玻片上，通過染色后在顯微鏡下觀察做出判斷。
3.PCR檢測：PCR檢測是核酸擴增技術的一種檢測，通過提取HPV病毒的遺傳物質，然後進行加速擴增，可以將正常情況的分裂周期加速，進而檢查HPV的類型。