HPV6型病毒感染是否可以徹底治癒，應根據具體情況進行分析。只是單純的病毒感染，無任何癥狀或者發生尖銳濕疣，一般都能治癒；但若持續感染，誘發癌前期病變或宮頸癌，徹底治癒的可能性較小。
HPV6也就是HPV6型病毒，這是一種低危型HPV病毒，該病毒對身體健康造成的危害相對較小，大多數情況下都能徹底治癒。感染HPV6型病毒后，有80%的幾率可以轉陰，無需進行特殊治療，只要身體免疫情況良好，自身免疫細胞會逐漸將病毒清除，從陽性轉為陰性，這個過程平均需要10個月。
有一部分患者感染這種病毒後會出現尖銳濕疣，雖然尖銳濕疣是一種性傳播疾病，但該病屬於良性病變。即便不進行治療，大多數患者可以在1~2年內自行轉陰，疣體較大者可以通過激光或冷凍方式將其清除。
極少數患者會發生持續感染，雖然HPV6型病毒屬於低危型HPV病毒，但持續感染也可能引起嚴重的病變，如宮頸癌前病變或者宮頸癌。宮頸癌前病變及時進行宮頸錐切手術治療，治癒的可能性比較大，發展成宮頸癌，早期通過根治性手術治療能達到臨床治癒，中晚期無法治癒。